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分子动力学模拟结合相溶解度研究非诺贝特与甲基-β-环糊精的包合行为
摘要: 目的 研究甲基-β-环糊精(RMβCD)对非诺贝特(FNB)增溶能力和包合机理。方法 以FNB和RMβCD为模型药物和增溶载体,通过相溶解度法结合分子动力学模拟研究FNB-RMβCD包合物中主客体分子的相互作用和结合过程的动态变化。结果 FNB与RMβCD的相溶解度曲线属于AL型,形成1:1摩尔比的包合物,25、35、45 °C三个温度下的包合稳定常数Ks分别为4969.90、5833.21、7141.07 L·mol-1,分子对接中通过分子间作用力FNB的苯环部分从环糊精大口一侧进入疏水空腔中。 200 ns的分子动力学模拟中,FNB、RMβCD和包合物的RMSD波动幅度较小。FNB和RMβCD的结合自由能为-12.76 ±1.84kcal/mol, 包合物的形成为非外力驱动的自发过程,其中分子力学项是结合自由能的主要贡献者,而溶剂化能对结合自由能呈负面作用。结论 RMβCD对FNB有良好的增溶能力,包合行为是一个自发过程。
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