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基于网络药理学和分子对接探讨半 4
  

目的基于网络药理学和分子对接探讨半夏中药成分对治疗乳腺癌的作用与发挥机制,引导大致方向与实际中的实验操作,给予一定程度的理论指引方法:通过查找筛选后获得半夏中药材有效化学成分,找到有效化学成分与乳腺癌相关对应的靶点基因。再在GeneCards中检索到乳腺癌的靶点基因,将乳腺癌的靶点基因与已筛选出的半夏有效化学成分应的靶点基进行对比,交集即可获得乳腺癌相关基中可能被半夏作用的靶点基因,从而可获得半夏中可能对乳腺癌起到抑制作用的有效化学成分。从 PPI 图中分析PPI度值,以猜测药物分子对应的靶点。其次,为获得半夏作用于乳腺癌靶点基因富集相关通路而采用运用 KEGG通富集解析。通过 GO-BP分析可以获得半夏作乳腺癌靶能发程。分子对接软件与升级版程序Autodock4.1、vina.Exe和3D结构软件Chem3D经由官方网站获得后,对已获得数据信息进行处理。受体大分子去水加氢之后保存为pdbqt格式后再对配体小分子进行能量最小化保存为mol2格式,随后通过Autodock软件进行分子对接。可视化处理结果从PyMol软件中运行获得。 :共 116,经一定条件筛选后获得的半夏化学成分中有效化学成分为13,其对应的靶点基因共有 100 种。制作 PPI 网络图,去除游离的节点后,还有63 种节点, KEGG 通路富集分析后发现有 70 条相关通路。讨论:半夏中以 β-谷甾醇、豆甾醇、黄芩苷、鱼子酱、松柏苷为主的有效化学成分,通过多种通路,对乳腺癌起作用,关键靶点 AKT1HIF1A、FOSTP53HSP90AA1、VEGFAMMP9CASP3PPARG。可能发生的生物过程有Pathways in cancer、Neuroactive ligand-receptor interaction、Chemical carcinogenesis - receptor activation。分子对接结果显示,所选取的五种半夏有效化学成分β-谷甾醇、豆甾醇、黄芩苷、鱼子酱和松柏苷可以与乳腺癌关键靶点蛋白稳定结合。



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