文章简介
基于生物标签模式探究杜仲的治疗潜能及作用机制
目的:基于生物标签模式探讨杜仲的治疗潜能及潜在作用机制。方法:搜集大量与杜仲相关的文献资料,并从中收集与整理杜仲的化学成分,筛选可用成分,并预测对应的作用靶点;使用Venny数据库进行化学成分与靶点取重;采用String数据库进行蛋白互作(PPI)网络的构建与分析,再利用Cytoscape v3.6.1软件对PPI网络图进行可视化处理并筛选出核心靶点;通过DAVID数据库对选取可能性大于1的靶点进行GO和KEGG通路富集分析;使用CTD数据库预测疾病,并筛选重复次数多的疾病;利用Cytoscape v3.6.1软件进行“药物-活性成分-靶蛋白-疾病”构建与分析。结果:筛选出杜仲20个化学成分,包括绿原酸、谷氨酸、异槲皮素、没食子酸、紫云英苷、咖啡酸等;化合物对应的靶点有55个,包含GRM8、GRM7、GRM3、GRM2、GRM4、GRM6、GRM5、GRM1、GRIK5、GRIK2、PTGS2、GRIA2、GRIA1、SLC1A1等。主要涉及碳酸氢根转运、碳代谢过程、突触传递的调节、谷氨酸能、腺苷酸环化酶抑制G蛋白偶联谷氨酸受体信号通路、离子型谷氨酸受体信号通路等生物过程。靶点对应的通路为9条,分别为氮代谢通路、谷氨酸能突触、刺激神经组织的中的交互等。主要涉及的疾病有肝癌、肺癌、精神分裂症、癫痫等。结论:我们通过生物标签模式预测的结果与文献报道的一致,表明利用生物标签探究中药的治疗潜能及分子机制的方法具有可行性。结果显示杜仲在肿瘤、精神分裂症、癫痫等疾病具有多靶点多通路特点,为后续深入探究其临床应用及具体机制提供了基础。
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