梭菌(Clostridia)和嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter)是目前被认为最有希望满足CBP要求的微生物类群。它们能够降解包括纤维素在内的许多复杂的碳水化合物，并将不同的单糖(包括戊糖和己糖)发酵为乙醇。本项目的总体目标为：筛选和改造能够满足CBP 需求且高效降解经预处理秸秆，产生二或单糖的菌株及共利用己糖和戊糖发酵生产4-6% (v/v)乙醇的菌株；建立和完善相关菌株的遗传操作工具和体系，并对菌株进行遗传改造获得能够耐受高浓度乙醇和纤维素预处理抑制物的耐高温突变菌株，进而获得高乙醇耐受或高乙醇耐受并且高产的菌株。其具体研究内容为：（1）建立和完善难培养微生物筛选策略，从极端环境筛选纤维素降解菌（群），解析纤维素降解酶及关键因子；（2）研究微生物协同降解纤维素机制，微生物间互作机制，解析协同降解过程中关键因子；（3）研究高温整合生物加工高效菌株电子传递，解析限制高效发酵产醇的机制。